Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN3Q5MJ09 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPANXN3Q5MJ09 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXN3Q5MJ09 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXN3Q5MJ09 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXN3Q5MJ09 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXN3Q5MJ09 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXN3Q5MJ09 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXN3Q5MJ09 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXN3Q5MJ09 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXN3Q5MJ09 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXN3Q5MJ09 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXN3Q5MJ09 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXN3Q5MJ09 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXN3Q5MJ09 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXN3Q5MJ09 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPANXN3Q5MJ09 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN3Q5MJ09 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms