Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms