Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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