Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC142Q17RM4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms