Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RBBP7Q16576 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RBBP7Q16576 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms