Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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EXT1Q16394 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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EXT1Q16394 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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EXT1Q16394 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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EXT1Q16394 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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EXT1Q16394 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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EXT1Q16394 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EXT1Q16394 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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