Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNIP1Q15025 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms