Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCLAFQ15004 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms