Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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DDX39BQ13838 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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DDX39BQ13838 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DDX39BQ13838 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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