Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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TCIRG1Q13488 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TCIRG1Q13488 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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