Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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