Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PMS2P3Q13401 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PMS2P3Q13401 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms