Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PRKAA1Q13131 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PRKAA1Q13131 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PRKAA1Q13131 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PRKAA1Q13131 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PRKAA1Q13131 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PRKAA1Q13131 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PRKAA1Q13131 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRKAA1Q13131 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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