Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FOXD4Q12950 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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