Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA3Q08378 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms