Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSC2Q02487 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms