Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2BQ00403 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms