Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SIM1P81133 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SIM1P81133 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SIM1P81133 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SIM1P81133 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SIM1P81133 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms