Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SH3BP2P78314 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP2P78314 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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