Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERVS71-1P61550 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERVS71-1P61550 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms