Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCCD1P59942 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms