Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC12A2P55011 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms