Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO1P25800 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO1P25800 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO1P25800 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO1P25800 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO1P25800 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LMO1P25800 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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