Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA4P25789 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms