Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCNA2P20248 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms