Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTN1P12814 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms