Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms