Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC28A2O43868 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms