Protein–RNA interactions for Protein: O15265

ATXN7, Ataxin-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7O15265 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATXN7O15265 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATXN7O15265 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATXN7O15265 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATXN7O15265 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATXN7O15265 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ATXN7O15265 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATXN7O15265 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATXN7O15265 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATXN7O15265 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATXN7O15265 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATXN7O15265 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATXN7O15265 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATXN7O15265 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATXN7O15265 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATXN7O15265 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATXN7O15265 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATXN7O15265 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms