Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BCKDKO14874 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BCKDKO14874 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms