Protein–RNA interactions for Protein: E2RYF7

HCG22, Protein PBMUCL2, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG22E2RYF7 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
HCG22E2RYF7 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms