Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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GGTLC3B5MD39 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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GGTLC3B5MD39 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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GGTLC3B5MD39 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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GGTLC3B5MD39 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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GGTLC3B5MD39 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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GGTLC3B5MD39 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GGTLC3B5MD39 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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