Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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LINC00587B1AMM8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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LINC00587B1AMM8 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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LINC00587B1AMM8 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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LINC00587B1AMM8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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LINC00587B1AMM8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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LINC00587B1AMM8 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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LINC00587B1AMM8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00587B1AMM8 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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