Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F8A0AVK6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F8A0AVK6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms