Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PIAS3Q9Y6X2 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms