Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW8

ZNF180, Zinc finger protein 180, humanhuman

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Length 692 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF180Q9UJW8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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ZNF180Q9UJW8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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ZNF180Q9UJW8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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ZNF180Q9UJW8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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ZNF180Q9UJW8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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ZNF180Q9UJW8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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ZNF180Q9UJW8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF180Q9UJW8 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF180Q9UJW8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF180Q9UJW8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF180Q9UJW8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF180Q9UJW8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF180Q9UJW8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF180Q9UJW8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF180Q9UJW8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF180Q9UJW8 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF180Q9UJW8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF180Q9UJW8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF180Q9UJW8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF180Q9UJW8 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF180Q9UJW8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF180Q9UJW8 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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