Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPMQ9NSP4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPMQ9NSP4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPMQ9NSP4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPMQ9NSP4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPMQ9NSP4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPMQ9NSP4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPMQ9NSP4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPMQ9NSP4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPMQ9NSP4 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPMQ9NSP4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPMQ9NSP4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPMQ9NSP4 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPMQ9NSP4 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPMQ9NSP4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPMQ9NSP4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPMQ9NSP4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPMQ9NSP4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPMQ9NSP4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPMQ9NSP4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPMQ9NSP4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPMQ9NSP4 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPMQ9NSP4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPMQ9NSP4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPMQ9NSP4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CENPMQ9NSP4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CENPMQ9NSP4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms