Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMG20AQ9NP66 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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