Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RHOJQ9H4E5 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms