Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms