Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BRIP1Q9BX63 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms