Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms