Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 LINC00685-201ENST00000391707 428 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SPOCK3Q9BQ16 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms