Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIN3AQ96ST3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIN3AQ96ST3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms