Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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