Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC97Q96F63 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms