Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RSPRY1Q96DX4 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSPRY1Q96DX4 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RSPRY1Q96DX4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RSPRY1Q96DX4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSPRY1Q96DX4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RSPRY1Q96DX4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms