Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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GTF3C6Q969F1 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C6Q969F1 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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GTF3C6Q969F1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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GTF3C6Q969F1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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GTF3C6Q969F1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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GTF3C6Q969F1 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C6Q969F1 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
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