Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE22

SETD9, SET domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD9Q8NE22 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SETD9Q8NE22 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.3 ms