Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1M1

BEST3, Bestrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3Q8N1M1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BEST3Q8N1M1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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BEST3Q8N1M1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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BEST3Q8N1M1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BEST3Q8N1M1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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